Gereja PNIEL Wayame (yang sering disebut sebagai bagian dari situs sejarah/budaya di Ambon) dan Gereja Pniel di beberapa titik lain di Maluku memiliki nilai historis tinggi, namun jika merujuk pada daftar Cagar Budaya Peringkat Kota Ambon yang ditetapkan secara resmi, fokus utamanya adalah pada arsitektur dan peran sejarahnya dalam rekonsiliasi.

Berikut adalah informasi mengenai status dan nilai sejarahnya:

Nilai Sejarah dan Arsitektur

• Simbol Perdamaian: Gereja Pniel (khususnya di kawasan Wayame) dikenal sebagai simbol Laboratorium Perdamaian. Saat konflik kemanusiaan melanda Ambon tahun 1999, kawasan ini tetap terjaga sebagai wilayah netral di mana masyarakat Muslim dan Kristen saling melindungi.
• Arsitektur Kolonial: Beberapa bangunan Gereja Pniel di Maluku (seperti di Saparua atau bagian tua Kota Ambon) memiliki ciri khas arsitektur kolonial dengan dinding tebal, jendela tinggi, dan lonceng gereja tua peninggalan masa Belanda.

Status Cagar Budaya

• Inventarisasi: Hingga Maret 2026, banyak bangunan gereja tua di Ambon masuk dalam daftar Objek Diduga Cagar Budaya (ODCB). Pemerintah melalui Balai Pelestarian Kebudayaan (BPK) Wilayah XX terus melakukan verifikasi fisik untuk menaikkan statusnya menjadi Cagar Budaya tetap.
• Perlindungan: Sebagai tempat ibadah yang memiliki nilai sejarah, bangunan ini dilindungi oleh Undang-Undang No. 11 Tahun 2010 tentang Cagar Budaya, yang melarang perubahan bentuk asli bangunan tanpa izin dari ahli cagar budaya.

Fungsi Sosial 

• Pusat Komunitas: Selain tempat ibadah, gereja-gereja bersejarah ini menjadi daya tarik wisata religi di Kota Ambon.
• Pendidikan Budaya: Sering menjadi objek studi bagi mahasiswa dan peneliti terkait arsitektur tropis peninggalan kolonial di Maluku.